Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms