Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E1P51965 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E1P51965 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E1P51965 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E1P51965 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E1P51965 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E1P51965 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E1P51965 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E1P51965 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E1P51965 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E1P51965 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E1P51965 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E1P51965 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E1P51965 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms