Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK4P51957 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK4P51957 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK4P51957 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK4P51957 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK4P51957 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK4P51957 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK4P51957 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK4P51957 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK4P51957 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK4P51957 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK4P51957 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK4P51957 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK4P51957 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK4P51957 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK4P51957 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEK4P51957 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEK4P51957 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NEK4P51957 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEK4P51957 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEK4P51957 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEK4P51957 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEK4P51957 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEK4P51957 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEK4P51957 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NEK4P51957 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NEK4P51957 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NEK4P51957 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEK4P51957 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEK4P51957 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEK4P51957 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEK4P51957 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEK4P51957 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEK4P51957 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEK4P51957 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEK4P51957 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEK4P51957 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NEK4P51957 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NEK4P51957 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NEK4P51957 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEK4P51957 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEK4P51957 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEK4P51957 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEK4P51957 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEK4P51957 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEK4P51957 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEK4P51957 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEK4P51957 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NEK4P51957 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEK4P51957 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEK4P51957 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NEK4P51957 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEK4P51957 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEK4P51957 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEK4P51957 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEK4P51957 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEK4P51957 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEK4P51957 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEK4P51957 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEK4P51957 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEK4P51957 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEK4P51957 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEK4P51957 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NEK4P51957 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEK4P51957 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEK4P51957 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEK4P51957 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEK4P51957 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEK4P51957 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEK4P51957 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEK4P51957 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEK4P51957 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEK4P51957 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEK4P51957 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEK4P51957 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEK4P51957 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEK4P51957 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEK4P51957 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEK4P51957 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEK4P51957 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEK4P51957 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEK4P51957 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEK4P51957 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEK4P51957 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEK4P51957 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEK4P51957 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEK4P51957 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEK4P51957 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NEK4P51957 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEK4P51957 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEK4P51957 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEK4P51957 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEK4P51957 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEK4P51957 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEK4P51957 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEK4P51957 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEK4P51957 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEK4P51957 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEK4P51957 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEK4P51957 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms