Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPT1P50897 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPT1P50897 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPT1P50897 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPT1P50897 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPT1P50897 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPT1P50897 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPT1P50897 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPT1P50897 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPT1P50897 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPT1P50897 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPT1P50897 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPT1P50897 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPT1P50897 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPT1P50897 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPT1P50897 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPT1P50897 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPT1P50897 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPT1P50897 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPT1P50897 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPT1P50897 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPT1P50897 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPT1P50897 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPT1P50897 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPT1P50897 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPT1P50897 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPT1P50897 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPT1P50897 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPT1P50897 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPT1P50897 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPT1P50897 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPT1P50897 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPT1P50897 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPT1P50897 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPT1P50897 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPT1P50897 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPT1P50897 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPT1P50897 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPT1P50897 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPT1P50897 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPT1P50897 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPT1P50897 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPT1P50897 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPT1P50897 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPT1P50897 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PPT1P50897 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPT1P50897 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPT1P50897 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPT1P50897 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPT1P50897 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PPT1P50897 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPT1P50897 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPT1P50897 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPT1P50897 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPT1P50897 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPT1P50897 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPT1P50897 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPT1P50897 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPT1P50897 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPT1P50897 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPT1P50897 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPT1P50897 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPT1P50897 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPT1P50897 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPT1P50897 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPT1P50897 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPT1P50897 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPT1P50897 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPT1P50897 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPT1P50897 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPT1P50897 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPT1P50897 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPT1P50897 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPT1P50897 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms