Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BCAMP50895 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCAMP50895 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCAMP50895 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCAMP50895 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCAMP50895 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCAMP50895 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCAMP50895 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAMP50895 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAMP50895 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAMP50895 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAMP50895 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAMP50895 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAMP50895 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAMP50895 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAMP50895 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAMP50895 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAMP50895 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAMP50895 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAMP50895 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAMP50895 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAMP50895 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAMP50895 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAMP50895 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAMP50895 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAMP50895 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAMP50895 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAMP50895 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCAMP50895 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCAMP50895 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCAMP50895 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCAMP50895 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCAMP50895 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCAMP50895 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BCAMP50895 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCAMP50895 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCAMP50895 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCAMP50895 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCAMP50895 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BCAMP50895 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCAMP50895 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCAMP50895 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCAMP50895 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCAMP50895 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCAMP50895 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCAMP50895 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCAMP50895 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCAMP50895 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCAMP50895 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCAMP50895 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCAMP50895 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCAMP50895 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCAMP50895 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCAMP50895 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCAMP50895 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCAMP50895 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCAMP50895 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCAMP50895 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BCAMP50895 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCAMP50895 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCAMP50895 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCAMP50895 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCAMP50895 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCAMP50895 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCAMP50895 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCAMP50895 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCAMP50895 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCAMP50895 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCAMP50895 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCAMP50895 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCAMP50895 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCAMP50895 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCAMP50895 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCAMP50895 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCAMP50895 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCAMP50895 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCAMP50895 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCAMP50895 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCAMP50895 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCAMP50895 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCAMP50895 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCAMP50895 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCAMP50895 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCAMP50895 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCAMP50895 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCAMP50895 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCAMP50895 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCAMP50895 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCAMP50895 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCAMP50895 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCAMP50895 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCAMP50895 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCAMP50895 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BCAMP50895 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAMP50895 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAMP50895 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAMP50895 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAMP50895 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAMP50895 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAMP50895 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms