Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms