Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LHX1P48742 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LHX1P48742 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHX1P48742 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LHX1P48742 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHX1P48742 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHX1P48742 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX1P48742 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX1P48742 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX1P48742 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX1P48742 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX1P48742 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX1P48742 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX1P48742 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX1P48742 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX1P48742 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX1P48742 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LHX1P48742 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LHX1P48742 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LHX1P48742 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX1P48742 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX1P48742 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX1P48742 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX1P48742 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX1P48742 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX1P48742 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX1P48742 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX1P48742 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX1P48742 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX1P48742 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX1P48742 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX1P48742 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX1P48742 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX1P48742 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX1P48742 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX1P48742 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX1P48742 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX1P48742 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX1P48742 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LHX1P48742 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LHX1P48742 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX1P48742 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX1P48742 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX1P48742 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX1P48742 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX1P48742 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX1P48742 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX1P48742 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX1P48742 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX1P48742 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX1P48742 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHX1P48742 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX1P48742 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHX1P48742 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX1P48742 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX1P48742 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHX1P48742 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX1P48742 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX1P48742 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LHX1P48742 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX1P48742 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LHX1P48742 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX1P48742 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX1P48742 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX1P48742 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX1P48742 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX1P48742 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX1P48742 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX1P48742 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX1P48742 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX1P48742 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX1P48742 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX1P48742 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX1P48742 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms