Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms