Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLCP48506 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLCP48506 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLCP48506 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLCP48506 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLCP48506 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLCP48506 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLCP48506 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLCP48506 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLCP48506 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLCP48506 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLCP48506 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLCP48506 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLCP48506 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLCP48506 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLCP48506 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLCP48506 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLCP48506 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLCP48506 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLCP48506 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLCP48506 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLCP48506 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLCP48506 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLCP48506 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLCP48506 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLCP48506 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLCP48506 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLCP48506 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLCP48506 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLCP48506 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLCP48506 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLCP48506 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLCP48506 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLCP48506 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLCP48506 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLCP48506 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLCP48506 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLCP48506 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLCP48506 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLCP48506 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLCP48506 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLCP48506 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLCP48506 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLCP48506 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLCP48506 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLCP48506 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLCP48506 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLCP48506 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLCP48506 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLCP48506 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLCP48506 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLCP48506 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLCP48506 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLCP48506 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLCP48506 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLCP48506 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLCP48506 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLCP48506 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLCP48506 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLCP48506 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLCP48506 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLCP48506 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLCP48506 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLCP48506 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLCP48506 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLCP48506 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLCP48506 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLCP48506 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLCP48506 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCLCP48506 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCLCP48506 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCLCP48506 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCLCP48506 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCLCP48506 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCLCP48506 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCLCP48506 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCLCP48506 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCLCP48506 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCLCP48506 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCLCP48506 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCLCP48506 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCLCP48506 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCLCP48506 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCLCP48506 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCLCP48506 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLCP48506 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLCP48506 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLCP48506 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLCP48506 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLCP48506 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLCP48506 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLCP48506 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLCP48506 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLCP48506 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLCP48506 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLCP48506 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLCP48506 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLCP48506 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLCP48506 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLCP48506 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms