Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIP4K2AP48426 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIP4K2AP48426 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIP4K2AP48426 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIP4K2AP48426 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIP4K2AP48426 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIP4K2AP48426 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PIP4K2AP48426 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIP4K2AP48426 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIP4K2AP48426 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PIP4K2AP48426 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIP4K2AP48426 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIP4K2AP48426 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIP4K2AP48426 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIP4K2AP48426 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIP4K2AP48426 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIP4K2AP48426 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIP4K2AP48426 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIP4K2AP48426 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PIP4K2AP48426 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PIP4K2AP48426 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms