Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX5P48382 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX5P48382 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX5P48382 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX5P48382 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX5P48382 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX5P48382 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX5P48382 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX5P48382 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX5P48382 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX5P48382 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX5P48382 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX5P48382 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX5P48382 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX5P48382 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX5P48382 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX5P48382 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX5P48382 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX5P48382 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX5P48382 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX5P48382 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX5P48382 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX5P48382 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX5P48382 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX5P48382 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX5P48382 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX5P48382 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX5P48382 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX5P48382 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX5P48382 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX5P48382 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX5P48382 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX5P48382 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX5P48382 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX5P48382 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX5P48382 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX5P48382 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX5P48382 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX5P48382 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX5P48382 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX5P48382 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX5P48382 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX5P48382 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX5P48382 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX5P48382 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX5P48382 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX5P48382 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX5P48382 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX5P48382 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX5P48382 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX5P48382 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX5P48382 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX5P48382 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX5P48382 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX5P48382 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX5P48382 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX5P48382 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX5P48382 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX5P48382 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX5P48382 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX5P48382 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX5P48382 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX5P48382 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX5P48382 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX5P48382 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX5P48382 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX5P48382 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX5P48382 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX5P48382 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX5P48382 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX5P48382 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX5P48382 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX5P48382 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX5P48382 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX5P48382 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX5P48382 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX5P48382 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX5P48382 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX5P48382 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX5P48382 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX5P48382 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX5P48382 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms