Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.72□□□□□ -2.53
PDR11P40550 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt-0.72□□□□□ -2.53
PDR11P40550 snR44snR44 211 nt-0.72□□□□□ -2.53
PDR11P40550 COY1YKL179C 2040 nt-0.73□□□□□ -2.53
PDR11P40550 YCR022CYCR022C 345 nt-0.73□□□□□ -2.53
PDR11P40550 YHR054CYHR054C 1065 nt-0.73□□□□□ -2.53
PDR11P40550 RSM23YGL129C 1353 nt-0.74□□□□□ -2.53
PDR11P40550 PAA1YDR071C 576 nt-0.74□□□□□ -2.53
PDR11P40550 SPC24YMR117C 642 nt-0.74□□□□□ -2.53
PDR11P40550 NIP1YMR309C 2439 nt-0.74□□□□□ -2.53
PDR11P40550 YJL135WYJL135W 318 nt-0.75□□□□□ -2.53
PDR11P40550 YGL204CYGL204C 306 nt-0.76□□□□□ -2.53
PDR11P40550 TIM13YGR181W 318 nt-0.76□□□□□ -2.53
PDR11P40550 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-0.77□□□□□ -2.53
PDR11P40550 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.77□□□□□ -2.53
PDR11P40550 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.77□□□□□ -2.53
PDR11P40550 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.77□□□□□ -2.53
PDR11P40550 YOR364WYOR364W 369 nt-0.79□□□□□ -2.54
PDR11P40550 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt-0.8□□□□□ -2.54
PDR11P40550 YKL111CYKL111C 336 nt-0.8□□□□□ -2.54
PDR11P40550 HTB2YBL002W 396 nt-0.8□□□□□ -2.54
PDR11P40550 YAP6YDR259C 1152 nt-0.81□□□□□ -2.54
PDR11P40550 ACF4YJR083C 930 nt-0.81□□□□□ -2.54
PDR11P40550 YOL160WYOL160W 342 nt-0.81□□□□□ -2.54
PDR11P40550 YDR269CYDR269C 324 nt-0.81□□□□□ -2.54
PDR11P40550 RPS30AYLR287C-A 192 nt-0.81□□□□□ -2.54
PDR11P40550 SNU56YDR240C 1479 nt-0.82□□□□□ -2.54
PDR11P40550 PTP2YOR208W 2253 nt-0.83□□□□□ -2.54
PDR11P40550 LRP1YHR081W 555 nt-0.84□□□□□ -2.54
PDR11P40550 LIN1YHR156C 1023 nt-0.84□□□□□ -2.54
PDR11P40550 YOR345CYOR345C 351 nt-0.84□□□□□ -2.54
PDR11P40550 YLR198CYLR198C 360 nt-0.85□□□□□ -2.55
PDR11P40550 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt-0.85□□□□□ -2.55
PDR11P40550 PBI2YNL015W 228 nt-0.85□□□□□ -2.55
PDR11P40550 UBS1YBR165W 834 nt-0.85□□□□□ -2.55
PDR11P40550 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt-0.86□□□□□ -2.55
PDR11P40550 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt-0.86□□□□□ -2.55
PDR11P40550 SPO21YOL091W 1830 nt-0.87□□□□□ -2.55
PDR11P40550 YPL205CYPL205C 345 nt-0.88□□□□□ -2.55
PDR11P40550 YER188C-AYER188C-A 300 nt-0.89□□□□□ -2.55
PDR11P40550 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.9□□□□□ -2.55
PDR11P40550 YIR044CYIR044C 186 nt-0.9□□□□□ -2.55
PDR11P40550 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt-0.9□□□□□ -2.55
PDR11P40550 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-0.9□□□□□ -2.55
PDR11P40550 YOR248WYOR248W 303 nt-0.9□□□□□ -2.55
PDR11P40550 RRI2YOL117W 1938 nt-0.91□□□□□ -2.55
PDR11P40550 POL32YJR043C 1053 nt-0.92□□□□□ -2.56
PDR11P40550 YJR141WYJR141W 1044 nt-0.92□□□□□ -2.56
PDR11P40550 CWC23YGL128C 852 nt-0.93□□□□□ -2.56
PDR11P40550 YPL261CYPL261C 309 nt-0.93□□□□□ -2.56
PDR11P40550 ATG16YMR159C 453 nt-0.94□□□□□ -2.56
PDR11P40550 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.95□□□□□ -2.56
PDR11P40550 snR161snR161 161 nt-0.95□□□□□ -2.56
PDR11P40550 snR36snR36 182 nt-0.95□□□□□ -2.56
PDR11P40550 LOC1YFR001W 615 nt-0.96□□□□□ -2.56
PDR11P40550 SRB7YDR308C 423 nt-0.97□□□□□ -2.56
PDR11P40550 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.97□□□□□ -2.56
PDR11P40550 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt-0.98□□□□□ -2.57
PDR11P40550 snR33snR33 183 nt-0.98□□□□□ -2.57
PDR11P40550 DIE2YGR227W 1578 nt-0.98□□□□□ -2.57
PDR11P40550 YML108WYML108W 318 nt-0.98□□□□□ -2.57
PDR11P40550 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.99□□□□□ -2.57
PDR11P40550 YPR096CYPR096C 303 nt-1□□□□□ -2.57
PDR11P40550 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-1.01□□□□□ -2.57
PDR11P40550 snR34snR34 203 nt-1.01□□□□□ -2.57
PDR11P40550 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt-1.02□□□□□ -2.57
PDR11P40550 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt-1.02□□□□□ -2.57
PDR11P40550 DCP1YOL149W 696 nt-1.02□□□□□ -2.57
PDR11P40550 YGR115CYGR115C 780 nt-1.03□□□□□ -2.57
PDR11P40550 YJL120WYJL120W 324 nt-1.03□□□□□ -2.57
PDR11P40550 YLR171WYLR171W 390 nt-1.03□□□□□ -2.57
PDR11P40550 VAM3YOR106W 852 nt-1.03□□□□□ -2.57
PDR11P40550 IRC16YPR038W 360 nt-1.03□□□□□ -2.57
PDR11P40550 SEM1YDR363W-A 270 nt-1.04□□□□□ -2.58
PDR11P40550 IPP1YBR011C 864 nt-1.04□□□□□ -2.58
PDR11P40550 YKL202WYKL202W 582 nt-1.05□□□□□ -2.58
PDR11P40550 ECL1YGR146C 636 nt-1.06□□□□□ -2.58
PDR11P40550 RPL22BYFL034C-A 369 nt-1.06□□□□□ -2.58
PDR11P40550 YGL239CYGL239C 315 nt-1.06□□□□□ -2.58
PDR11P40550 ILM1YJR118C 612 nt-1.06□□□□□ -2.58
PDR11P40550 COG6YNL041C 2520 nt-1.07□□□□□ -2.58
PDR11P40550 YDR220CYDR220C 294 nt-1.07□□□□□ -2.58
PDR11P40550 MRPS8YMR158W 468 nt-1.07□□□□□ -2.58
PDR11P40550 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-1.07□□□□□ -2.58
PDR11P40550 BUD26YDR241W 288 nt-1.08□□□□□ -2.58
PDR11P40550 RPS20YHL015W 366 nt-1.09□□□□□ -2.58
PDR11P40550 YLR287CYLR287C 1068 nt-1.09□□□□□ -2.58
PDR11P40550 YNL319WYNL319W 441 nt-1.09□□□□□ -2.58
PDR11P40550 YGL015CYGL015C 393 nt-1.12□□□□□ -2.59
PDR11P40550 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt-1.12□□□□□ -2.59
PDR11P40550 snR72snR72 98 nt-1.15□□□□□ -2.59
PDR11P40550 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-1.16□□□□□ -2.6
PDR11P40550 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-1.18□□□□□ -2.6
PDR11P40550 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-1.18□□□□□ -2.6
PDR11P40550 GRX5YPL059W 453 nt-1.18□□□□□ -2.6
PDR11P40550 YGR228WYGR228W 345 nt-1.19□□□□□ -2.6
PDR11P40550 snR51snR51 107 nt-1.19□□□□□ -2.6
PDR11P40550 ATG31YDR022C 591 nt-1.2□□□□□ -2.6
PDR11P40550 YBR099CYBR099C 384 nt-1.2□□□□□ -2.6
PDR11P40550 MRPL32YCR003W 552 nt-1.21□□□□□ -2.6
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