Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF4A3P38919 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms