Protein–RNA interactions for Protein: P38868

YHR180W, Uncharacterized protein YHR180W, yeastyeast

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR180WP38868 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.6□□□□□ -2.31
YHR180WP38868 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.6□□□□□ -2.31
YHR180WP38868 YPL261CYPL261C 309 nt0.6□□□□□ -2.31
YHR180WP38868 INP2YMR163C 2118 nt0.59□□□□□ -2.31
YHR180WP38868 OST1YJL002C 1431 nt0.59□□□□□ -2.31
YHR180WP38868 UBC7YMR022W 498 nt0.59□□□□□ -2.31
YHR180WP38868 UBP3YER151C 2739 nt0.58□□□□□ -2.32
YHR180WP38868 DBP6YNR038W 1890 nt0.58□□□□□ -2.32
YHR180WP38868 RAD34YDR314C 2079 nt0.58□□□□□ -2.32
YHR180WP38868 RKR1YMR247C 4689 nt0.58□□□□□ -2.32
YHR180WP38868 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.58□□□□□ -2.32
YHR180WP38868 CUL3YGR003W 2235 nt0.58□□□□□ -2.32
YHR180WP38868 PAN2YGL094C 3348 nt0.57□□□□□ -2.32
YHR180WP38868 SWF1YDR126W 1011 nt0.57□□□□□ -2.32
YHR180WP38868 ISD11YER048W-A 285 nt0.57□□□□□ -2.32
YHR180WP38868 ISF1YMR081C 1017 nt0.57□□□□□ -2.32
YHR180WP38868 MRPL50YNR022C 420 nt0.57□□□□□ -2.32
YHR180WP38868 YIR044CYIR044C 186 nt0.56□□□□□ -2.32
YHR180WP38868 RPS24BYIL069C 408 nt0.55□□□□□ -2.32
YHR180WP38868 YLR456WYLR456W 615 nt0.55□□□□□ -2.32
YHR180WP38868 YOR282WYOR282W 321 nt0.55□□□□□ -2.32
YHR180WP38868 YDR344CYDR344C 444 nt0.54□□□□□ -2.32
YHR180WP38868 MAM33YIL070C 801 nt0.54□□□□□ -2.32
YHR180WP38868 YMR160WYMR160W 2451 nt0.54□□□□□ -2.32
YHR180WP38868 ATG31YDR022C 591 nt0.53□□□□□ -2.32
YHR180WP38868 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.53□□□□□ -2.32
YHR180WP38868 YLL007CYLL007C 1998 nt0.53□□□□□ -2.32
YHR180WP38868 BFR2YDR299W 1605 nt0.53□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 RPS20YHL015W 366 nt0.52□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 YHL042WYHL042W 453 nt0.52□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.52□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.52□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.52□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.52□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 YDL073WYDL073W 2955 nt0.51□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 YDR426CYDR426C 378 nt0.51□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 YJL007CYJL007C 315 nt0.51□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 YJR011CYJR011C 786 nt0.51□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.5□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.5□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 PTP2YOR208W 2253 nt0.5□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 ECM12YHR021W-A 456 nt0.49□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 YKL063CYKL063C 504 nt0.49□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 YPL185WYPL185W 396 nt0.49□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 YPL205CYPL205C 345 nt0.49□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 YBR064WYBR064W 429 nt0.49□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 NIP100YPL174C 2607 nt0.48□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 OLI1Q0130 231 nt0.48□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 YPL044CYPL044C 549 nt0.48□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 Q0017Q0017 162 nt0.48□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 UTP10YJL109C 5310 nt0.48□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 PCC1YKR095W-A 267 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 RPL38YLR325C 237 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR180WP38868 NPR2YEL062W 1848 nt0.46□□□□□ -2.34
YHR180WP38868 YOR218CYOR218C 420 nt0.46□□□□□ -2.34
YHR180WP38868 YBR206WYBR206W 324 nt0.46□□□□□ -2.34
YHR180WP38868 NOP9YJL010C 2001 nt0.46□□□□□ -2.34
YHR180WP38868 MCM10YIL150C 1716 nt0.46□□□□□ -2.34
YHR180WP38868 PMP1YCR024C-A 123 nt0.45□□□□□ -2.34
YHR180WP38868 YLR434CYLR434C 384 nt0.45□□□□□ -2.34
YHR180WP38868 CHS6YJL099W 2241 nt0.44□□□□□ -2.34
YHR180WP38868 YLR202CYLR202C 327 nt0.44□□□□□ -2.34
YHR180WP38868 YPL068CYPL068C 882 nt0.44□□□□□ -2.34
YHR180WP38868 YCK3YER123W 1575 nt0.44□□□□□ -2.34
YHR180WP38868 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.43□□□□□ -2.34
YHR180WP38868 LTE1YAL024C 4308 nt0.42□□□□□ -2.34
YHR180WP38868 PAA1YDR071C 576 nt0.42□□□□□ -2.34
YHR180WP38868 SPO21YOL091W 1830 nt0.42□□□□□ -2.34
YHR180WP38868 YML002WYML002W 2214 nt0.41□□□□□ -2.34
YHR180WP38868 HMRA2YCR096C 360 nt0.41□□□□□ -2.34
YHR180WP38868 BSC3YLR465C 309 nt0.41□□□□□ -2.34
YHR180WP38868 VPS20YMR077C 666 nt0.41□□□□□ -2.34
YHR180WP38868 YOR053WYOR053W 342 nt0.41□□□□□ -2.34
YHR180WP38868 YNL324WYNL324W 396 nt0.4□□□□□ -2.35
YHR180WP38868 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.4□□□□□ -2.35
YHR180WP38868 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.4□□□□□ -2.35
YHR180WP38868 UTP20YBL004W 7482 nt0.39□□□□□ -2.35
YHR180WP38868 RPL26BYGR034W 384 nt0.39□□□□□ -2.35
YHR180WP38868 YBR285WYBR285W 435 nt0.39□□□□□ -2.35
YHR180WP38868 PRP16YKR086W 3216 nt0.37□□□□□ -2.35
YHR180WP38868 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.37□□□□□ -2.35
YHR180WP38868 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.37□□□□□ -2.35
YHR180WP38868 YJR157WYJR157W 363 nt0.37□□□□□ -2.35
YHR180WP38868 PRM3YPL192C 402 nt0.37□□□□□ -2.35
YHR180WP38868 CSN9YDR179C 489 nt0.36□□□□□ -2.35
YHR180WP38868 YLR334CYLR334C 381 nt0.36□□□□□ -2.35
YHR180WP38868 YNL211CYNL211C 261 nt0.36□□□□□ -2.35
YHR180WP38868 YER079WYER079W 633 nt0.35□□□□□ -2.35
YHR180WP38868 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.35□□□□□ -2.35
YHR180WP38868 YAR029WYAR029W 225 nt0.35□□□□□ -2.35
YHR180WP38868 SGF11YPL047W 300 nt0.35□□□□□ -2.35
YHR180WP38868 ULP2YIL031W 3105 nt0.34□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.1 ms