Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNCAP37840 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNCAP37840 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNCAP37840 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNCAP37840 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNCAP37840 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCAP37840 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCAP37840 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCAP37840 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCAP37840 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCAP37840 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCAP37840 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCAP37840 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCAP37840 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCAP37840 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCAP37840 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCAP37840 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCAP37840 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCAP37840 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCAP37840 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCAP37840 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCAP37840 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCAP37840 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCAP37840 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCAP37840 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCAP37840 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCAP37840 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCAP37840 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNCAP37840 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNCAP37840 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SNCAP37840 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNCAP37840 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCAP37840 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCAP37840 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCAP37840 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCAP37840 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCAP37840 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCAP37840 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCAP37840 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCAP37840 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCAP37840 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCAP37840 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCAP37840 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCAP37840 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCAP37840 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCAP37840 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCAP37840 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCAP37840 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCAP37840 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCAP37840 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCAP37840 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCAP37840 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCAP37840 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCAP37840 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCAP37840 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNCAP37840 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNCAP37840 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNCAP37840 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNCAP37840 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNCAP37840 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNCAP37840 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNCAP37840 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNCAP37840 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNCAP37840 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNCAP37840 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNCAP37840 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNCAP37840 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNCAP37840 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNCAP37840 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNCAP37840 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms