Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms