Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJC1P36383 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJC1P36383 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJC1P36383 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJC1P36383 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJC1P36383 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
GJC1P36383 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJC1P36383 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJC1P36383 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJC1P36383 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJC1P36383 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GJC1P36383 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJC1P36383 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJC1P36383 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJC1P36383 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJC1P36383 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJC1P36383 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJC1P36383 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJC1P36383 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJC1P36383 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJC1P36383 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GJC1P36383 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJC1P36383 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJC1P36383 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJC1P36383 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJC1P36383 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJC1P36383 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJC1P36383 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJC1P36383 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJC1P36383 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJC1P36383 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJC1P36383 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJC1P36383 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GJC1P36383 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJC1P36383 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GJC1P36383 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJC1P36383 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJC1P36383 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJC1P36383 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJC1P36383 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJC1P36383 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJC1P36383 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJC1P36383 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJC1P36383 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJC1P36383 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJC1P36383 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJC1P36383 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJC1P36383 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJC1P36383 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJC1P36383 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJC1P36383 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJC1P36383 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJC1P36383 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJC1P36383 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJC1P36383 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJC1P36383 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJC1P36383 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJC1P36383 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GJC1P36383 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJC1P36383 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJC1P36383 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJC1P36383 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJC1P36383 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJC1P36383 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJC1P36383 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJC1P36383 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJC1P36383 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJC1P36383 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJC1P36383 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJC1P36383 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJC1P36383 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJC1P36383 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GJC1P36383 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GJC1P36383 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJC1P36383 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJC1P36383 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJC1P36383 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJC1P36383 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJC1P36383 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJC1P36383 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJC1P36383 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJC1P36383 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJC1P36383 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJC1P36383 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJC1P36383 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJC1P36383 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJC1P36383 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJC1P36383 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJC1P36383 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJC1P36383 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GJC1P36383 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJC1P36383 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms