Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT2P35908 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT2P35908 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT2P35908 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT2P35908 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT2P35908 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT2P35908 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT2P35908 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT2P35908 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT2P35908 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT2P35908 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT2P35908 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT2P35908 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT2P35908 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT2P35908 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT2P35908 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT2P35908 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT2P35908 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT2P35908 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT2P35908 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT2P35908 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT2P35908 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT2P35908 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT2P35908 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT2P35908 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT2P35908 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT2P35908 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT2P35908 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT2P35908 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT2P35908 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT2P35908 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT2P35908 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT2P35908 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT2P35908 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT2P35908 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT2P35908 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT2P35908 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT2P35908 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT2P35908 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT2P35908 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT2P35908 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT2P35908 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT2P35908 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT2P35908 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT2P35908 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT2P35908 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT2P35908 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT2P35908 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT2P35908 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT2P35908 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT2P35908 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT2P35908 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT2P35908 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT2P35908 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT2P35908 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT2P35908 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT2P35908 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT2P35908 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT2P35908 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT2P35908 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT2P35908 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT2P35908 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT2P35908 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT2P35908 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT2P35908 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
KRT2P35908 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT2P35908 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT2P35908 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT2P35908 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT2P35908 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT2P35908 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT2P35908 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT2P35908 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT2P35908 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT2P35908 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT2P35908 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT2P35908 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT2P35908 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT2P35908 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT2P35908 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT2P35908 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT2P35908 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT2P35908 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT2P35908 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT2P35908 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT2P35908 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT2P35908 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT2P35908 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT2P35908 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT2P35908 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT2P35908 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT2P35908 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT2P35908 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT2P35908 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRT2P35908 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRT2P35908 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT2P35908 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT2P35908 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT2P35908 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT2P35908 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms