Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms