Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GPC1P35052 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPC1P35052 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GPC1P35052 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPC1P35052 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GPC1P35052 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GPC1P35052 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPC1P35052 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GPC1P35052 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPC1P35052 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPC1P35052 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPC1P35052 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPC1P35052 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPC1P35052 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPC1P35052 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPC1P35052 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPC1P35052 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPC1P35052 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPC1P35052 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPC1P35052 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPC1P35052 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPC1P35052 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPC1P35052 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPC1P35052 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPC1P35052 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPC1P35052 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPC1P35052 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPC1P35052 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPC1P35052 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPC1P35052 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPC1P35052 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPC1P35052 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPC1P35052 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPC1P35052 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPC1P35052 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPC1P35052 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPC1P35052 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GPC1P35052 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GPC1P35052 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GPC1P35052 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPC1P35052 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPC1P35052 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPC1P35052 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPC1P35052 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPC1P35052 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPC1P35052 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPC1P35052 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPC1P35052 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPC1P35052 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPC1P35052 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GPC1P35052 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPC1P35052 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPC1P35052 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPC1P35052 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPC1P35052 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPC1P35052 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPC1P35052 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPC1P35052 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPC1P35052 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPC1P35052 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPC1P35052 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPC1P35052 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPC1P35052 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPC1P35052 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPC1P35052 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPC1P35052 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms