Protein–RNA interactions for Protein: P34077

NIC96, Nucleoporin NIC96, yeastyeast

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIC96P34077 NOC3YLR002C 1992 nt1.83□□□□□ -2.12
NIC96P34077 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.82□□□□□ -2.12
NIC96P34077 GYP5YPL249C 2685 nt1.82□□□□□ -2.12
NIC96P34077 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.82□□□□□ -2.12
NIC96P34077 RAD34YDR314C 2079 nt1.81□□□□□ -2.12
NIC96P34077 SPO24YPR036W-A 204 nt1.81□□□□□ -2.12
NIC96P34077 SPO75YLL005C 2607 nt1.8□□□□□ -2.12
NIC96P34077 UFD2YDL190C 2886 nt1.8□□□□□ -2.12
NIC96P34077 YIR044CYIR044C 186 nt1.79□□□□□ -2.12
NIC96P34077 YJL022WYJL022W 309 nt1.79□□□□□ -2.12
NIC96P34077 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.79□□□□□ -2.12
NIC96P34077 YOR019WYOR019W 2193 nt1.79□□□□□ -2.12
NIC96P34077 NCA2YPR155C 1851 nt1.78□□□□□ -2.12
NIC96P34077 COF1YLL050C 432 nt1.78□□□□□ -2.12
NIC96P34077 ALK1YGL021W 2283 nt1.78□□□□□ -2.13
NIC96P34077 SEC5YDR166C 2916 nt1.77□□□□□ -2.13
NIC96P34077 RAD50YNL250W 3939 nt1.77□□□□□ -2.13
NIC96P34077 snR74snR74 88 nt1.77□□□□□ -2.13
NIC96P34077 VPS55YJR044C 423 nt1.77□□□□□ -2.13
NIC96P34077 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.77□□□□□ -2.13
NIC96P34077 YPR092WYPR092W 306 nt1.77□□□□□ -2.13
NIC96P34077 MON2YNL297C 4911 nt1.77□□□□□ -2.13
NIC96P34077 KAP122YGL016W 3246 nt1.77□□□□□ -2.13
NIC96P34077 RTP1YMR185W 2946 nt1.76□□□□□ -2.13
NIC96P34077 ISD11YER048W-A 285 nt1.76□□□□□ -2.13
NIC96P34077 YHR210CYHR210C 1026 nt1.76□□□□□ -2.13
NIC96P34077 YLR294CYLR294C 330 nt1.76□□□□□ -2.13
NIC96P34077 YLR422WYLR422W 5799 nt1.76□□□□□ -2.13
NIC96P34077 BST1YFL025C 3090 nt1.75□□□□□ -2.13
NIC96P34077 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.75□□□□□ -2.13
NIC96P34077 SLI15YBR156C 2097 nt1.75□□□□□ -2.13
NIC96P34077 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt1.75□□□□□ -2.13
NIC96P34077 YGL217CYGL217C 342 nt1.75□□□□□ -2.13
NIC96P34077 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.75□□□□□ -2.13
NIC96P34077 YOR376WYOR376W 369 nt1.75□□□□□ -2.13
NIC96P34077 KIP1YBL063W 3336 nt1.75□□□□□ -2.13
NIC96P34077 YLR419WYLR419W 4308 nt1.74□□□□□ -2.13
NIC96P34077 RPL34BYIL052C 366 nt1.74□□□□□ -2.13
NIC96P34077 YJL182CYJL182C 318 nt1.74□□□□□ -2.13
NIC96P34077 RRT15YLR162W-A 189 nt1.74□□□□□ -2.13
NIC96P34077 SPO21YOL091W 1830 nt1.74□□□□□ -2.13
NIC96P34077 PEP1YBL017C 4740 nt1.74□□□□□ -2.13
NIC96P34077 VPS15YBR097W 4365 nt1.73□□□□□ -2.13
NIC96P34077 RPS27BYHR021C 249 nt1.73□□□□□ -2.13
NIC96P34077 YLR140WYLR140W 327 nt1.73□□□□□ -2.13
NIC96P34077 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt1.73□□□□□ -2.13
NIC96P34077 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.73□□□□□ -2.13
NIC96P34077 YLL054CYLL054C 2532 nt1.73□□□□□ -2.13
NIC96P34077 SLX4YLR135W 2247 nt1.72□□□□□ -2.13
NIC96P34077 TRM3YDL112W 4311 nt1.72□□□□□ -2.13
NIC96P34077 SGF11YPL047W 300 nt1.72□□□□□ -2.13
NIC96P34077 CUL3YGR003W 2235 nt1.72□□□□□ -2.13
NIC96P34077 SMC4YLR086W 4257 nt1.71□□□□□ -2.13
NIC96P34077 ALY2YJL084C 3141 nt1.71□□□□□ -2.14
NIC96P34077 YJL120WYJL120W 324 nt1.71□□□□□ -2.14
NIC96P34077 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.71□□□□□ -2.14
NIC96P34077 YOR218CYOR218C 420 nt1.71□□□□□ -2.14
NIC96P34077 COG4YPR105C 2586 nt1.7□□□□□ -2.14
NIC96P34077 OLI1Q0130 231 nt1.7□□□□□ -2.14
NIC96P34077 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.7□□□□□ -2.14
NIC96P34077 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.7□□□□□ -2.14
NIC96P34077 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.7□□□□□ -2.14
NIC96P34077 PTP2YOR208W 2253 nt1.69□□□□□ -2.14
NIC96P34077 YKU70YMR284W 1809 nt1.69□□□□□ -2.14
NIC96P34077 YGR151CYGR151C 336 nt1.69□□□□□ -2.14
NIC96P34077 YJL150WYJL150W 303 nt1.69□□□□□ -2.14
NIC96P34077 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.69□□□□□ -2.14
NIC96P34077 RPS25BYLR333C 327 nt1.68□□□□□ -2.14
NIC96P34077 IFH1YLR223C 3258 nt1.68□□□□□ -2.14
NIC96P34077 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.66□□□□□ -2.14
NIC96P34077 YBR174CYBR174C 315 nt1.66□□□□□ -2.14
NIC96P34077 YLL007CYLL007C 1998 nt1.66□□□□□ -2.14
NIC96P34077 PKH2YOL100W 3246 nt1.66□□□□□ -2.14
NIC96P34077 SXM1YDR395W 2835 nt1.66□□□□□ -2.14
NIC96P34077 AIM44YPL158C 2277 nt1.65□□□□□ -2.14
NIC96P34077 YEL014CYEL014C 306 nt1.65□□□□□ -2.15
NIC96P34077 EST2YLR318W 2655 nt1.65□□□□□ -2.15
NIC96P34077 SBE22YHR103W 2559 nt1.64□□□□□ -2.15
NIC96P34077 MCM10YIL150C 1716 nt1.64□□□□□ -2.15
NIC96P34077 MMS4YBR098W 2076 nt1.64□□□□□ -2.15
NIC96P34077 CLU1YMR012W 3834 nt1.64□□□□□ -2.15
NIC96P34077 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.64□□□□□ -2.15
NIC96P34077 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.62□□□□□ -2.15
NIC96P34077 PAN2YGL094C 3348 nt1.62□□□□□ -2.15
NIC96P34077 YDR521WYDR521W 336 nt1.62□□□□□ -2.15
NIC96P34077 ECM12YHR021W-A 456 nt1.62□□□□□ -2.15
NIC96P34077 YNL338WYNL338W 159 nt1.62□□□□□ -2.15
NIC96P34077 snR14snR14 160 nt1.62□□□□□ -2.15
NIC96P34077 SWI4YER111C 3282 nt1.62□□□□□ -2.15
NIC96P34077 MSN5YDR335W 3675 nt1.62□□□□□ -2.15
NIC96P34077 PIP2YOR363C 2991 nt1.62□□□□□ -2.15
NIC96P34077 PRP39YML046W 1890 nt1.61□□□□□ -2.15
NIC96P34077 AZF1YOR113W 2745 nt1.61□□□□□ -2.15
NIC96P34077 TRS65YGR166W 1683 nt1.61□□□□□ -2.15
NIC96P34077 PBY1YBR094W 2262 nt1.6□□□□□ -2.15
NIC96P34077 IRA1YBR140C 9279 nt1.6□□□□□ -2.15
NIC96P34077 CFT1YDR301W 4074 nt1.59□□□□□ -2.15
NIC96P34077 snR46snR46 197 nt1.59□□□□□ -2.15
NIC96P34077 MEC1YBR136W 7107 nt1.59□□□□□ -2.16
NIC96P34077 YDL206WYDL206W 2289 nt1.59□□□□□ -2.16
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