Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms