Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCND3P30281 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND3P30281 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND3P30281 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND3P30281 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND3P30281 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND3P30281 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND3P30281 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND3P30281 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND3P30281 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND3P30281 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND3P30281 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND3P30281 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND3P30281 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND3P30281 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND3P30281 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND3P30281 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND3P30281 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND3P30281 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND3P30281 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND3P30281 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND3P30281 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND3P30281 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND3P30281 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND3P30281 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND3P30281 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND3P30281 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND3P30281 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND3P30281 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND3P30281 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND3P30281 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND3P30281 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND3P30281 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND3P30281 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND3P30281 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND3P30281 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND3P30281 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND3P30281 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND3P30281 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND3P30281 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND3P30281 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND3P30281 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND3P30281 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND3P30281 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND3P30281 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND3P30281 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND3P30281 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND3P30281 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND3P30281 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND3P30281 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND3P30281 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND3P30281 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND3P30281 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND3P30281 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND3P30281 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND3P30281 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND3P30281 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND3P30281 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND3P30281 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND3P30281 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND3P30281 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND3P30281 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND3P30281 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND3P30281 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND3P30281 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND3P30281 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND3P30281 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND3P30281 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND3P30281 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND3P30281 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCND3P30281 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND3P30281 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND3P30281 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND3P30281 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND3P30281 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND3P30281 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND3P30281 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND3P30281 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND3P30281 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND3P30281 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND3P30281 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND3P30281 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND3P30281 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND3P30281 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND3P30281 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND3P30281 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND3P30281 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND3P30281 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND3P30281 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND3P30281 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND3P30281 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND3P30281 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND3P30281 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND3P30281 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND3P30281 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND3P30281 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND3P30281 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND3P30281 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND3P30281 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND3P30281 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms