Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms