Protein–RNA interactions for Protein: P26599

PTBP1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP1P26599 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.144e-13■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.124e-13■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 KXD1-213ENST00000600372 656 ntTSL 314.26□□□□□ -0.134e-13■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.224e-13■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.494e-13■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.754e-13■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 KXD1-210ENST00000599000 498 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.824e-13■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 KXD1-207ENST00000596785 712 ntTSL 59.93□□□□□ -0.824e-13■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 KXD1-216ENST00000601630 1327 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.954e-13■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 KXD1-214ENST00000600654 895 ntTSL 58.71□□□□□ -1.024e-13■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC6.19□□□□□ -1.427e-10■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 TTC19-204ENST00000470399 636 ntTSL 518.08■□□□□ 0.484e-8■■■■■ 32.8
PTBP1P26599 TTC19-203ENST00000466729 908 ntTSL 517.61■□□□□ 0.414e-8■■■■■ 32.8
PTBP1P26599 ACSM3-203ENST00000501740 839 ntTSL 510.37□□□□□ -0.751e-13■■■■■ 32.8
PTBP1P26599 ACSM3-213ENST00000568235 558 ntTSL 49.02□□□□□ -0.971e-13■■■■■ 32.8
PTBP1P26599 ACSM3-205ENST00000561584 561 ntTSL 48.71□□□□□ -1.021e-13■■■■■ 32.8
PTBP1P26599 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.09□□□□□ -1.439e-7■■■■■ 32.8
PTBP1P26599 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 32.8
PTBP1P26599 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 32.8
PTBP1P26599 CENPA-204ENST00000460030 745 ntTSL 1 (best)14.93□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 32.8
PTBP1P26599 CENPA-203ENST00000419525 950 ntTSL 512.36□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 32.8
PTBP1P26599 CENPA-205ENST00000472719 689 ntTSL 311.09□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 32.8
PTBP1P26599 CENPA-206ENST00000475662 1208 ntTSL 210.98□□□□□ -0.652e-6■■■■■ 32.8
PTBP1P26599 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.287e-8■■■■■ 32.8
PTBP1P26599 PLXNB1-203ENST00000449094 3863 ntTSL 211.35□□□□□ -0.597e-8■■■■■ 32.8
PTBP1P26599 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.578e-7■■■■■ 32.8
PTBP1P26599 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.38e-7■■■■■ 32.8
PTBP1P26599 CCDC91-205ENST00000536442 1301 ntTSL 514.18□□□□□ -0.148e-7■■■■■ 32.8
PTBP1P26599 CCDC91-203ENST00000535520 1626 ntTSL 25.59□□□□□ -1.528e-7■■■■■ 32.8
PTBP1P26599 CCDC91-211ENST00000540794 518 ntTSL 32.82□□□□□ -1.968e-7■■■■■ 32.8
PTBP1P26599 CCDC91-204ENST00000536154 549 ntTSL 41.57□□□□□ -2.168e-7■■■■■ 32.8
PTBP1P26599 METTL9-210ENST00000570074 447 ntTSL 315.52■□□□□ 0.082e-15■■■■■ 32.8
PTBP1P26599 METTL9-203ENST00000562379 701 ntTSL 214.67□□□□□ -0.062e-15■■■■■ 32.8
PTBP1P26599 METTL9-204ENST00000562961 785 ntTSL 24.13□□□□□ -1.752e-15■■■■■ 32.8
PTBP1P26599 MALRD1-202ENST00000377266 4461 ntTSL 59.37□□□□□ -0.916e-7■■■■■ 32.8
PTBP1P26599 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.746e-7■■■■■ 32.8
PTBP1P26599 MLLT10-208ENST00000438473 1085 ntTSL 54.73□□□□□ -1.658e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 HBG2-203ENST00000380259 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.872e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 HBG2-202ENST00000380252 694 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 HBE1-202ENST00000380237 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.212e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 HBE1-203ENST00000396895 578 ntTSL 54.62□□□□□ -1.672e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 RBM41-206ENST00000475556 346 ntTSL 55.5□□□□□ -1.531e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 RBM41-207ENST00000485676 925 ntTSL 24.53□□□□□ -1.681e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 RBM41-203ENST00000434854 680 ntTSL 54.28□□□□□ -1.721e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.323e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 DLEU1-205ENST00000463357 274 ntTSL 1 (best)4.93□□□□□ -1.627e-8■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 MED12-203ENST00000374102 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.811e-8■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 MED12-201ENST00000333646 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.011e-8■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.111e-8■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.531e-9■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.528e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.528e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.878e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.858e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.838e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.818e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.788e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 PRPSAP2-202ENST00000395656 1540 ntTSL 219.46■□□□□ 0.718e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.718e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 PRPSAP2-219ENST00000571907 537 ntTSL 419.17■□□□□ 0.668e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 PRPSAP2-210ENST00000455992 908 ntTSL 519.08■□□□□ 0.648e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 PRPSAP2-225ENST00000575228 504 ntTSL 518.87■□□□□ 0.618e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.618e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.568e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.567e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 MTMR14-210ENST00000447144 1664 ntTSL 218.42■□□□□ 0.548e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 MATK-210ENST00000590849 571 ntTSL 418.01■□□□□ 0.478e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.437e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.428e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.418e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.398e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.398e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 ARFRP1-211ENST00000618568 1612 ntTSL 317.25■□□□□ 0.358e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 PRPSAP2-206ENST00000419284 950 ntTSL 316.63■□□□□ 0.258e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.238e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.228e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.158e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.148e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.118e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 INPP1-207ENST00000423767 840 ntTSL 315.45■□□□□ 0.067e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 INPP1-210ENST00000444194 797 ntTSL 215.22■□□□□ 0.037e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -08e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.018e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 SPPL3-208ENST00000543854 508 ntTSL 514.58□□□□□ -0.088e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 INPP1-213ENST00000458647 626 ntTSL 414.51□□□□□ -0.097e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 MATK-207ENST00000590028 724 ntTSL 414.47□□□□□ -0.098e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 CABIN1-208ENST00000467937 593 ntTSL 314.46□□□□□ -0.098e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.18e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.18e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.118e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 ARFRP1-206ENST00000610774 5178 ntTSL 214.03□□□□□ -0.168e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.178e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.238e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.268e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.288e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 AC004922.1-202ENST00000441989 1702 ntTSL 213.19□□□□□ -0.38e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 LAT-216ENST00000570232 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.14□□□□□ -0.318e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 PRPSAP2-224ENST00000575102 556 ntTSL 413.1□□□□□ -0.318e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 LAT-207ENST00000562701 816 ntTSL 1 (best)12.83□□□□□ -0.368e-7■■■■■ 32.7
PTBP1P26599 MTMR14-204ENST00000414996 1746 ntTSL 1 (best)12.72□□□□□ -0.378e-7■■■■■ 32.7
Retrieved 100 of 27,725 protein–RNA pairs in 161.6 ms