Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YY1P25490 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YY1P25490 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YY1P25490 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YY1P25490 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YY1P25490 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YY1P25490 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YY1P25490 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YY1P25490 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YY1P25490 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
YY1P25490 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
YY1P25490 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YY1P25490 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YY1P25490 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YY1P25490 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YY1P25490 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YY1P25490 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YY1P25490 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YY1P25490 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YY1P25490 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YY1P25490 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YY1P25490 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YY1P25490 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YY1P25490 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YY1P25490 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
YY1P25490 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YY1P25490 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YY1P25490 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YY1P25490 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YY1P25490 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YY1P25490 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YY1P25490 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
YY1P25490 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
YY1P25490 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YY1P25490 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YY1P25490 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YY1P25490 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YY1P25490 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YY1P25490 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
YY1P25490 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YY1P25490 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YY1P25490 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YY1P25490 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YY1P25490 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YY1P25490 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YY1P25490 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YY1P25490 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YY1P25490 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
YY1P25490 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YY1P25490 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
YY1P25490 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YY1P25490 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YY1P25490 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YY1P25490 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YY1P25490 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YY1P25490 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YY1P25490 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YY1P25490 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YY1P25490 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YY1P25490 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YY1P25490 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YY1P25490 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
YY1P25490 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YY1P25490 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YY1P25490 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YY1P25490 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YY1P25490 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
YY1P25490 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YY1P25490 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
YY1P25490 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YY1P25490 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YY1P25490 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
YY1P25490 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
YY1P25490 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YY1P25490 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YY1P25490 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YY1P25490 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YY1P25490 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
YY1P25490 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
YY1P25490 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YY1P25490 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YY1P25490 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YY1P25490 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YY1P25490 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YY1P25490 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
YY1P25490 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YY1P25490 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YY1P25490 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YY1P25490 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YY1P25490 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YY1P25490 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YY1P25490 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YY1P25490 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YY1P25490 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YY1P25490 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
YY1P25490 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YY1P25490 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
YY1P25490 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
YY1P25490 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
YY1P25490 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms