Protein–RNA interactions for Protein: P22219

VPS15, Serine/threonine-protein kinase VPS15, yeastyeast

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS15P22219 PSF2YJL072C 642 nt-1.27□□□□□ -2.61
VPS15P22219 SMD2YLR275W 333 nt-1.28□□□□□ -2.61
VPS15P22219 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt-1.29□□□□□ -2.62
VPS15P22219 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt-1.29□□□□□ -2.62
VPS15P22219 RSM23YGL129C 1353 nt-1.29□□□□□ -2.62
VPS15P22219 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt-1.3□□□□□ -2.62
VPS15P22219 YHR138CYHR138C 345 nt-1.3□□□□□ -2.62
VPS15P22219 YLR271WYLR271W 825 nt-1.3□□□□□ -2.62
VPS15P22219 BLS1YLR408C 369 nt-1.3□□□□□ -2.62
VPS15P22219 YAP6YDR259C 1152 nt-1.31□□□□□ -2.62
VPS15P22219 PFS1YHR185C 714 nt-1.31□□□□□ -2.62
VPS15P22219 ZIP2YGL249W 2115 nt-1.31□□□□□ -2.62
VPS15P22219 YER076W-AYER076W-A 348 nt-1.31□□□□□ -2.62
VPS15P22219 YOR015WYOR015W 360 nt-1.31□□□□□ -2.62
VPS15P22219 YER079WYER079W 633 nt-1.32□□□□□ -2.62
VPS15P22219 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-1.32□□□□□ -2.62
VPS15P22219 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-1.32□□□□□ -2.62
VPS15P22219 ATP20YPR020W 348 nt-1.32□□□□□ -2.62
VPS15P22219 YPR099CYPR099C 357 nt-1.33□□□□□ -2.62
VPS15P22219 PAN3YKL025C 2040 nt-1.33□□□□□ -2.62
VPS15P22219 RPL29YFR032C-A 180 nt-1.34□□□□□ -2.62
VPS15P22219 YJL135WYJL135W 318 nt-1.34□□□□□ -2.62
VPS15P22219 GPX1YKL026C 504 nt-1.34□□□□□ -2.62
VPS15P22219 PCF11YDR228C 1881 nt-1.36□□□□□ -2.63
VPS15P22219 YGL042CYGL042C 306 nt-1.37□□□□□ -2.63
VPS15P22219 SDS22YKL193C 1017 nt-1.37□□□□□ -2.63
VPS15P22219 YBR099CYBR099C 384 nt-1.37□□□□□ -2.63
VPS15P22219 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt-1.37□□□□□ -2.63
VPS15P22219 EST1YLR233C 2100 nt-1.37□□□□□ -2.63
VPS15P22219 YER138W-AYER138W-A 105 nt-1.38□□□□□ -2.63
VPS15P22219 CMC1YKL137W 336 nt-1.38□□□□□ -2.63
VPS15P22219 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt-1.38□□□□□ -2.63
VPS15P22219 SPO21YOL091W 1830 nt-1.39□□□□□ -2.63
VPS15P22219 snR79snR79 84 nt-1.39□□□□□ -2.63
VPS15P22219 QCR7YDR529C 384 nt-1.4□□□□□ -2.63
VPS15P22219 RPF1YHR088W 888 nt-1.4□□□□□ -2.63
VPS15P22219 YPR142CYPR142C 564 nt-1.4□□□□□ -2.63
VPS15P22219 YLR171WYLR171W 390 nt-1.41□□□□□ -2.63
VPS15P22219 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt-1.42□□□□□ -2.64
VPS15P22219 YER158W-AYER158W-A 216 nt-1.43□□□□□ -2.64
VPS15P22219 CMS1YLR003C 876 nt-1.43□□□□□ -2.64
VPS15P22219 SNU13YEL026W 381 nt-1.44□□□□□ -2.64
VPS15P22219 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.45□□□□□ -2.64
VPS15P22219 YLR041WYLR041W 321 nt-1.45□□□□□ -2.64
VPS15P22219 YML108WYML108W 318 nt-1.45□□□□□ -2.64
VPS15P22219 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-1.46□□□□□ -2.64
VPS15P22219 YOL160WYOL160W 342 nt-1.46□□□□□ -2.64
VPS15P22219 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt-1.47□□□□□ -2.64
VPS15P22219 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt-1.47□□□□□ -2.64
VPS15P22219 YHR054CYHR054C 1065 nt-1.47□□□□□ -2.64
VPS15P22219 PBI2YNL015W 228 nt-1.47□□□□□ -2.64
VPS15P22219 YOL029CYOL029C 606 nt-1.47□□□□□ -2.64
VPS15P22219 snR24snR24 89 nt-1.47□□□□□ -2.64
VPS15P22219 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-1.49□□□□□ -2.65
VPS15P22219 YLR282CYLR282C 342 nt-1.49□□□□□ -2.65
VPS15P22219 YMR254CYMR254C 309 nt-1.49□□□□□ -2.65
VPS15P22219 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt-1.49□□□□□ -2.65
VPS15P22219 PAU9YBL108C-A 129 nt-1.49□□□□□ -2.65
VPS15P22219 SDH7YDR511W 402 nt-1.5□□□□□ -2.65
VPS15P22219 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt-1.5□□□□□ -2.65
VPS15P22219 DCP1YOL149W 696 nt-1.5□□□□□ -2.65
VPS15P22219 PET20YPL159C 762 nt-1.5□□□□□ -2.65
VPS15P22219 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-1.51□□□□□ -2.65
VPS15P22219 YHL041WYHL041W 450 nt-1.52□□□□□ -2.65
VPS15P22219 YML100W-AYML100W-A 174 nt-1.52□□□□□ -2.65
VPS15P22219 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-1.52□□□□□ -2.65
VPS15P22219 RSM18YER050C 417 nt-1.53□□□□□ -2.65
VPS15P22219 YJL086CYJL086C 369 nt-1.53□□□□□ -2.65
VPS15P22219 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt-1.53□□□□□ -2.65
VPS15P22219 YJL182CYJL182C 318 nt-1.54□□□□□ -2.66
VPS15P22219 COX7YMR256C 183 nt-1.54□□□□□ -2.66
VPS15P22219 YDR269CYDR269C 324 nt-1.55□□□□□ -2.66
VPS15P22219 YGL182CYGL182C 324 nt-1.55□□□□□ -2.66
VPS15P22219 YGR228WYGR228W 345 nt-1.56□□□□□ -2.66
VPS15P22219 LRP1YHR081W 555 nt-1.56□□□□□ -2.66
VPS15P22219 RPS20YHL015W 366 nt-1.56□□□□□ -2.66
VPS15P22219 TAR1YLR154W-C 375 nt-1.56□□□□□ -2.66
VPS15P22219 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt-1.58□□□□□ -2.66
VPS15P22219 YIL032CYIL032C 357 nt-1.58□□□□□ -2.66
VPS15P22219 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-1.58□□□□□ -2.66
VPS15P22219 LOC1YFR001W 615 nt-1.59□□□□□ -2.66
VPS15P22219 APQ13YJL075C 417 nt-1.59□□□□□ -2.66
VPS15P22219 YER084W-AYER084W-A 513 nt-1.6□□□□□ -2.67
VPS15P22219 APQ12YIL040W 417 nt-1.6□□□□□ -2.67
VPS15P22219 BLI1YKL061W 342 nt-1.6□□□□□ -2.67
VPS15P22219 RPS10BYMR230W 318 nt-1.6□□□□□ -2.67
VPS15P22219 YPR092WYPR092W 306 nt-1.6□□□□□ -2.67
VPS15P22219 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-1.61□□□□□ -2.67
VPS15P22219 YIR044CYIR044C 186 nt-1.61□□□□□ -2.67
VPS15P22219 YBL062WYBL062W 381 nt-1.61□□□□□ -2.67
VPS15P22219 YPL261CYPL261C 309 nt-1.62□□□□□ -2.67
VPS15P22219 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt-1.63□□□□□ -2.67
VPS15P22219 LSM4YER112W 564 nt-1.65□□□□□ -2.67
VPS15P22219 DFG10YIL049W 762 nt-1.65□□□□□ -2.67
VPS15P22219 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.65□□□□□ -2.67
VPS15P22219 SPC24YMR117C 642 nt-1.65□□□□□ -2.67
VPS15P22219 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt-1.66□□□□□ -2.68
VPS15P22219 YKL111CYKL111C 336 nt-1.66□□□□□ -2.68
VPS15P22219 BER1YLR412W 825 nt-1.66□□□□□ -2.68
VPS15P22219 IRC16YPR038W 360 nt-1.66□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 49.3 ms