Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACO1P21399 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACO1P21399 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACO1P21399 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACO1P21399 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACO1P21399 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACO1P21399 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACO1P21399 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACO1P21399 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACO1P21399 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACO1P21399 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACO1P21399 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACO1P21399 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACO1P21399 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACO1P21399 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACO1P21399 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACO1P21399 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACO1P21399 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACO1P21399 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACO1P21399 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACO1P21399 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACO1P21399 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACO1P21399 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACO1P21399 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACO1P21399 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACO1P21399 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACO1P21399 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACO1P21399 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACO1P21399 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACO1P21399 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACO1P21399 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACO1P21399 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACO1P21399 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACO1P21399 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACO1P21399 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACO1P21399 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACO1P21399 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACO1P21399 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACO1P21399 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACO1P21399 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACO1P21399 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ACO1P21399 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACO1P21399 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACO1P21399 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACO1P21399 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACO1P21399 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACO1P21399 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACO1P21399 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACO1P21399 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACO1P21399 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACO1P21399 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACO1P21399 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACO1P21399 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACO1P21399 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACO1P21399 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACO1P21399 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACO1P21399 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACO1P21399 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACO1P21399 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACO1P21399 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACO1P21399 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACO1P21399 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACO1P21399 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACO1P21399 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACO1P21399 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ACO1P21399 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACO1P21399 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACO1P21399 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACO1P21399 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACO1P21399 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACO1P21399 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACO1P21399 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACO1P21399 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACO1P21399 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACO1P21399 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACO1P21399 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACO1P21399 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACO1P21399 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACO1P21399 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACO1P21399 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACO1P21399 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACO1P21399 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACO1P21399 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACO1P21399 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACO1P21399 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACO1P21399 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACO1P21399 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACO1P21399 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACO1P21399 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACO1P21399 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACO1P21399 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACO1P21399 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACO1P21399 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACO1P21399 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACO1P21399 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACO1P21399 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACO1P21399 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACO1P21399 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACO1P21399 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACO1P21399 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms