Protein–RNA interactions for Protein: P19419

ELK1, ETS domain-containing protein Elk-1, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK1P19419 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELK1P19419 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELK1P19419 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELK1P19419 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELK1P19419 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELK1P19419 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELK1P19419 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELK1P19419 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELK1P19419 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ELK1P19419 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ELK1P19419 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELK1P19419 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELK1P19419 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELK1P19419 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELK1P19419 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELK1P19419 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELK1P19419 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELK1P19419 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELK1P19419 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELK1P19419 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELK1P19419 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELK1P19419 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELK1P19419 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELK1P19419 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELK1P19419 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELK1P19419 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELK1P19419 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELK1P19419 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELK1P19419 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ELK1P19419 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELK1P19419 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELK1P19419 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELK1P19419 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELK1P19419 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELK1P19419 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELK1P19419 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELK1P19419 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELK1P19419 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELK1P19419 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELK1P19419 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELK1P19419 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELK1P19419 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ELK1P19419 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELK1P19419 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELK1P19419 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELK1P19419 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELK1P19419 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELK1P19419 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELK1P19419 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELK1P19419 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELK1P19419 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELK1P19419 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELK1P19419 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELK1P19419 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELK1P19419 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELK1P19419 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELK1P19419 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELK1P19419 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELK1P19419 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELK1P19419 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELK1P19419 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELK1P19419 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELK1P19419 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELK1P19419 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELK1P19419 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELK1P19419 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELK1P19419 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELK1P19419 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELK1P19419 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ELK1P19419 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELK1P19419 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELK1P19419 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELK1P19419 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms