Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT4P19013 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT4P19013 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT4P19013 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT4P19013 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT4P19013 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT4P19013 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT4P19013 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT4P19013 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT4P19013 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT4P19013 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT4P19013 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT4P19013 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT4P19013 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT4P19013 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT4P19013 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT4P19013 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT4P19013 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT4P19013 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT4P19013 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT4P19013 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT4P19013 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT4P19013 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT4P19013 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT4P19013 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT4P19013 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT4P19013 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT4P19013 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT4P19013 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT4P19013 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT4P19013 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT4P19013 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT4P19013 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT4P19013 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT4P19013 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT4P19013 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT4P19013 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT4P19013 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT4P19013 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT4P19013 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT4P19013 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT4P19013 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT4P19013 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT4P19013 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT4P19013 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT4P19013 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT4P19013 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT4P19013 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT4P19013 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT4P19013 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT4P19013 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT4P19013 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT4P19013 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT4P19013 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT4P19013 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT4P19013 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT4P19013 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT4P19013 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT4P19013 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT4P19013 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT4P19013 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT4P19013 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT4P19013 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT4P19013 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT4P19013 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT4P19013 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT4P19013 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT4P19013 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT4P19013 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT4P19013 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT4P19013 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT4P19013 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT4P19013 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT4P19013 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT4P19013 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT4P19013 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT4P19013 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT4P19013 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT4P19013 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT4P19013 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT4P19013 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT4P19013 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT4P19013 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT4P19013 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT4P19013 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT4P19013 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT4P19013 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT4P19013 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT4P19013 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT4P19013 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT4P19013 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT4P19013 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT4P19013 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT4P19013 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT4P19013 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT4P19013 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT4P19013 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT4P19013 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT4P19013 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT4P19013 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms