Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL17P18621 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL17P18621 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL17P18621 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL17P18621 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL17P18621 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL17P18621 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL17P18621 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPL17P18621 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL17P18621 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL17P18621 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL17P18621 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL17P18621 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL17P18621 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL17P18621 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL17P18621 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL17P18621 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL17P18621 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL17P18621 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL17P18621 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL17P18621 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL17P18621 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL17P18621 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL17P18621 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL17P18621 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL17P18621 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL17P18621 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL17P18621 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL17P18621 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL17P18621 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL17P18621 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL17P18621 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL17P18621 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL17P18621 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL17P18621 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL17P18621 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL17P18621 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL17P18621 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL17P18621 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL17P18621 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL17P18621 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL17P18621 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL17P18621 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL17P18621 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL17P18621 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL17P18621 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL17P18621 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL17P18621 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL17P18621 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL17P18621 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL17P18621 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL17P18621 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL17P18621 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL17P18621 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL17P18621 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL17P18621 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL17P18621 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL17P18621 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL17P18621 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL17P18621 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL17P18621 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL17P18621 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL17P18621 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL17P18621 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL17P18621 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL17P18621 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL17P18621 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL17P18621 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL17P18621 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL17P18621 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL17P18621 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL17P18621 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL17P18621 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL17P18621 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL17P18621 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL17P18621 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL17P18621 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL17P18621 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL17P18621 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL17P18621 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL17P18621 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL17P18621 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL17P18621 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL17P18621 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL17P18621 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL17P18621 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL17P18621 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL17P18621 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL17P18621 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL17P18621 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL17P18621 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL17P18621 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL17P18621 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL17P18621 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL17P18621 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL17P18621 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL17P18621 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL17P18621 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL17P18621 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL17P18621 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms