Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DESP17661 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DESP17661 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DESP17661 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DESP17661 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DESP17661 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DESP17661 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DESP17661 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DESP17661 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DESP17661 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DESP17661 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DESP17661 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DESP17661 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DESP17661 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DESP17661 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DESP17661 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DESP17661 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DESP17661 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DESP17661 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DESP17661 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DESP17661 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DESP17661 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DESP17661 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DESP17661 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DESP17661 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DESP17661 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DESP17661 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DESP17661 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DESP17661 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DESP17661 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DESP17661 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DESP17661 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DESP17661 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DESP17661 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DESP17661 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DESP17661 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DESP17661 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DESP17661 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DESP17661 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DESP17661 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DESP17661 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DESP17661 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DESP17661 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DESP17661 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DESP17661 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DESP17661 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DESP17661 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DESP17661 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DESP17661 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DESP17661 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DESP17661 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DESP17661 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DESP17661 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DESP17661 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DESP17661 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DESP17661 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DESP17661 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DESP17661 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DESP17661 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DESP17661 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DESP17661 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DESP17661 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DESP17661 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DESP17661 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DESP17661 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms