Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXB9P17482 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXB9P17482 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXB9P17482 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXB9P17482 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXB9P17482 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXB9P17482 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXB9P17482 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms