Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPCAMP16422 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms