Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD46P15529 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CD46P15529 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD46P15529 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD46P15529 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD46P15529 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD46P15529 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD46P15529 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD46P15529 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD46P15529 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD46P15529 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD46P15529 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD46P15529 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD46P15529 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD46P15529 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CD46P15529 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD46P15529 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD46P15529 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD46P15529 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD46P15529 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD46P15529 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CD46P15529 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD46P15529 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD46P15529 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD46P15529 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD46P15529 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD46P15529 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD46P15529 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD46P15529 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CD46P15529 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD46P15529 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD46P15529 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CD46P15529 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD46P15529 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD46P15529 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD46P15529 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD46P15529 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD46P15529 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD46P15529 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD46P15529 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD46P15529 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD46P15529 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD46P15529 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD46P15529 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD46P15529 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD46P15529 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD46P15529 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD46P15529 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD46P15529 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD46P15529 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CD46P15529 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD46P15529 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD46P15529 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD46P15529 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD46P15529 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD46P15529 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD46P15529 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD46P15529 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD46P15529 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD46P15529 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD46P15529 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD46P15529 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD46P15529 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD46P15529 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD46P15529 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD46P15529 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD46P15529 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD46P15529 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD46P15529 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CD46P15529 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD46P15529 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD46P15529 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD46P15529 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms