Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL5P13501 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL5P13501 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL5P13501 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL5P13501 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL5P13501 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL5P13501 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL5P13501 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL5P13501 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL5P13501 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL5P13501 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL5P13501 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL5P13501 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL5P13501 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL5P13501 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL5P13501 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL5P13501 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL5P13501 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL5P13501 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL5P13501 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL5P13501 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL5P13501 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL5P13501 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL5P13501 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL5P13501 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL5P13501 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL5P13501 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL5P13501 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL5P13501 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL5P13501 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL5P13501 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL5P13501 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL5P13501 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL5P13501 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL5P13501 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL5P13501 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL5P13501 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL5P13501 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL5P13501 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL5P13501 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL5P13501 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL5P13501 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL5P13501 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL5P13501 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL5P13501 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL5P13501 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL5P13501 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL5P13501 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL5P13501 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL5P13501 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL5P13501 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL5P13501 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL5P13501 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL5P13501 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL5P13501 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL5P13501 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL5P13501 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL5P13501 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL5P13501 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL5P13501 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL5P13501 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL5P13501 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL5P13501 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL5P13501 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL5P13501 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL5P13501 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL5P13501 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL5P13501 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL5P13501 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL5P13501 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL5P13501 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL5P13501 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL5P13501 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL5P13501 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL5P13501 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL5P13501 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL5P13501 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL5P13501 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL5P13501 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL5P13501 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL5P13501 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL5P13501 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL5P13501 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL5P13501 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL5P13501 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL5P13501 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL5P13501 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL5P13501 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL5P13501 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL5P13501 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL5P13501 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL5P13501 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL5P13501 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL5P13501 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL5P13501 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCL5P13501 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL5P13501 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL5P13501 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL5P13501 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL5P13501 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms