Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BMP3P12645 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BMP3P12645 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BMP3P12645 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BMP3P12645 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BMP3P12645 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BMP3P12645 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BMP3P12645 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BMP3P12645 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP3P12645 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP3P12645 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP3P12645 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP3P12645 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP3P12645 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP3P12645 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP3P12645 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP3P12645 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP3P12645 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP3P12645 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP3P12645 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP3P12645 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP3P12645 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP3P12645 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP3P12645 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP3P12645 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP3P12645 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP3P12645 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP3P12645 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP3P12645 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP3P12645 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP3P12645 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP3P12645 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP3P12645 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP3P12645 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP3P12645 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP3P12645 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP3P12645 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP3P12645 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP3P12645 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP3P12645 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP3P12645 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP3P12645 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP3P12645 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP3P12645 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP3P12645 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP3P12645 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP3P12645 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP3P12645 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP3P12645 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP3P12645 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP3P12645 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP3P12645 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP3P12645 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP3P12645 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
BMP3P12645 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP3P12645 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP3P12645 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP3P12645 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP3P12645 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP3P12645 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP3P12645 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP3P12645 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP3P12645 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP3P12645 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP3P12645 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP3P12645 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP3P12645 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP3P12645 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP3P12645 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP3P12645 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP3P12645 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP3P12645 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP3P12645 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP3P12645 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP3P12645 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms