Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLUP10909 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLUP10909 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLUP10909 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLUP10909 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLUP10909 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLUP10909 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLUP10909 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLUP10909 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLUP10909 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLUP10909 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLUP10909 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLUP10909 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLUP10909 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLUP10909 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLUP10909 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLUP10909 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLUP10909 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLUP10909 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLUP10909 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLUP10909 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLUP10909 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLUP10909 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLUP10909 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLUP10909 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLUP10909 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLUP10909 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLUP10909 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLUP10909 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLUP10909 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLUP10909 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLUP10909 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLUP10909 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLUP10909 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLUP10909 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLUP10909 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLUP10909 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLUP10909 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLUP10909 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms