Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR2F1P10589 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR2F1P10589 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NR2F1P10589 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms