Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3P10147 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3P10147 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3P10147 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3P10147 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3P10147 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3P10147 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3P10147 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3P10147 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3P10147 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3P10147 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3P10147 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3P10147 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3P10147 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3P10147 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3P10147 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3P10147 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3P10147 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3P10147 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3P10147 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3P10147 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3P10147 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3P10147 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3P10147 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3P10147 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3P10147 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3P10147 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3P10147 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3P10147 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3P10147 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3P10147 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3P10147 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3P10147 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3P10147 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3P10147 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3P10147 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3P10147 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3P10147 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3P10147 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3P10147 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3P10147 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3P10147 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3P10147 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3P10147 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3P10147 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3P10147 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3P10147 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3P10147 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3P10147 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3P10147 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3P10147 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3P10147 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3P10147 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3P10147 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3P10147 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3P10147 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3P10147 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3P10147 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3P10147 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3P10147 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3P10147 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3P10147 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3P10147 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3P10147 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3P10147 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3P10147 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3P10147 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3P10147 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3P10147 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3P10147 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3P10147 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3P10147 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms