Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms