Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM10L2BP0DMW5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM10L2BP0DMW5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM10L2BP0DMW5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms