Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms