Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP2CP0DJJ0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP2CP0DJJ0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms