Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms