Protein–RNA interactions for Protein: P08425

MSF1, Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSF1P08425 ECM12YHR021W-A 456 nt0.6□□□□□ -2.31
MSF1P08425 YHR130CYHR130C 336 nt0.6□□□□□ -2.31
MSF1P08425 YHL042WYHL042W 453 nt0.59□□□□□ -2.31
MSF1P08425 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.59□□□□□ -2.31
MSF1P08425 YLR287CYLR287C 1068 nt0.59□□□□□ -2.31
MSF1P08425 ZEO1YOL109W 342 nt0.59□□□□□ -2.31
MSF1P08425 CDC33YOL139C 642 nt0.59□□□□□ -2.31
MSF1P08425 UTP10YJL109C 5310 nt0.59□□□□□ -2.32
MSF1P08425 RAD34YDR314C 2079 nt0.58□□□□□ -2.32
MSF1P08425 AIM29YKR074W 468 nt0.58□□□□□ -2.32
MSF1P08425 snR51snR51 107 nt0.58□□□□□ -2.32
MSF1P08425 CUL3YGR003W 2235 nt0.58□□□□□ -2.32
MSF1P08425 BFR2YDR299W 1605 nt0.57□□□□□ -2.32
MSF1P08425 YIR044CYIR044C 186 nt0.57□□□□□ -2.32
MSF1P08425 RPL38YLR325C 237 nt0.56□□□□□ -2.32
MSF1P08425 ULP2YIL031W 3105 nt0.55□□□□□ -2.32
MSF1P08425 DIE2YGR227W 1578 nt0.55□□□□□ -2.32
MSF1P08425 PMP1YCR024C-A 123 nt0.55□□□□□ -2.32
MSF1P08425 YPL229WYPL229W 621 nt0.55□□□□□ -2.32
MSF1P08425 SDH7YDR511W 402 nt0.54□□□□□ -2.32
MSF1P08425 snR54snR54 86 nt0.54□□□□□ -2.32
MSF1P08425 YML002WYML002W 2214 nt0.54□□□□□ -2.32
MSF1P08425 FMP27YLR454W 7887 nt0.54□□□□□ -2.32
MSF1P08425 NPR2YEL062W 1848 nt0.53□□□□□ -2.32
MSF1P08425 YDR344CYDR344C 444 nt0.53□□□□□ -2.32
MSF1P08425 INP2YMR163C 2118 nt0.52□□□□□ -2.33
MSF1P08425 AI1Q0050 2505 nt0.52□□□□□ -2.33
MSF1P08425 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt0.52□□□□□ -2.33
MSF1P08425 BI2Q0110 1272 nt0.51□□□□□ -2.33
MSF1P08425 ECL1YGR146C 636 nt0.51□□□□□ -2.33
MSF1P08425 YNL058CYNL058C 951 nt0.51□□□□□ -2.33
MSF1P08425 YNL122CYNL122C 348 nt0.51□□□□□ -2.33
MSF1P08425 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.51□□□□□ -2.33
MSF1P08425 YPL044CYPL044C 549 nt0.51□□□□□ -2.33
MSF1P08425 YSP1YHR155W 3687 nt0.51□□□□□ -2.33
MSF1P08425 NOP9YJL010C 2001 nt0.5□□□□□ -2.33
MSF1P08425 BIR1YJR089W 2865 nt0.5□□□□□ -2.33
MSF1P08425 YHL041WYHL041W 450 nt0.5□□□□□ -2.33
MSF1P08425 YKL083WYKL083W 615 nt0.5□□□□□ -2.33
MSF1P08425 LTE1YAL024C 4308 nt0.49□□□□□ -2.33
MSF1P08425 RPL26AYLR344W 384 nt0.49□□□□□ -2.33
MSF1P08425 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.49□□□□□ -2.33
MSF1P08425 PTP2YOR208W 2253 nt0.49□□□□□ -2.33
MSF1P08425 CHS6YJL099W 2241 nt0.49□□□□□ -2.33
MSF1P08425 YLR171WYLR171W 390 nt0.48□□□□□ -2.33
MSF1P08425 YGR290WYGR290W 444 nt0.47□□□□□ -2.33
MSF1P08425 OLI1Q0130 231 nt0.46□□□□□ -2.34
MSF1P08425 MAM33YIL070C 801 nt0.46□□□□□ -2.34
MSF1P08425 YAR047CYAR047C 321 nt0.46□□□□□ -2.34
MSF1P08425 YBR064WYBR064W 429 nt0.45□□□□□ -2.34
MSF1P08425 CBS1YDL069C 690 nt0.44□□□□□ -2.34
MSF1P08425 YDL158CYDL158C 309 nt0.44□□□□□ -2.34
MSF1P08425 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.44□□□□□ -2.34
MSF1P08425 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.44□□□□□ -2.34
MSF1P08425 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.44□□□□□ -2.34
MSF1P08425 BSC3YLR465C 309 nt0.44□□□□□ -2.34
MSF1P08425 PCF11YDR228C 1881 nt0.44□□□□□ -2.34
MSF1P08425 YAP6YDR259C 1152 nt0.43□□□□□ -2.34
MSF1P08425 RPS20YHL015W 366 nt0.43□□□□□ -2.34
MSF1P08425 YPL185WYPL185W 396 nt0.43□□□□□ -2.34
MSF1P08425 RPL26BYGR034W 384 nt0.42□□□□□ -2.34
MSF1P08425 RPS24BYIL069C 408 nt0.42□□□□□ -2.34
MSF1P08425 FYV7YLR068W 456 nt0.42□□□□□ -2.34
MSF1P08425 ATG31YDR022C 591 nt0.41□□□□□ -2.34
MSF1P08425 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.41□□□□□ -2.34
MSF1P08425 YJR011CYJR011C 786 nt0.41□□□□□ -2.34
MSF1P08425 YLR101CYLR101C 396 nt0.41□□□□□ -2.34
MSF1P08425 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.41□□□□□ -2.34
MSF1P08425 MCM10YIL150C 1716 nt0.41□□□□□ -2.34
MSF1P08425 SPO21YOL091W 1830 nt0.41□□□□□ -2.34
MSF1P08425 YBR206WYBR206W 324 nt0.4□□□□□ -2.35
MSF1P08425 snR41snR41 95 nt0.4□□□□□ -2.35
MSF1P08425 UTP8YGR128C 2142 nt0.4□□□□□ -2.35
MSF1P08425 PAA1YDR071C 576 nt0.39□□□□□ -2.35
MSF1P08425 IQG1YPL242C 4488 nt0.38□□□□□ -2.35
MSF1P08425 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.38□□□□□ -2.35
MSF1P08425 ABF2YMR072W 552 nt0.37□□□□□ -2.35
MSF1P08425 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.37□□□□□ -2.35
MSF1P08425 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.36□□□□□ -2.35
MSF1P08425 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.36□□□□□ -2.35
MSF1P08425 TOM22YNL131W 459 nt0.36□□□□□ -2.35
MSF1P08425 PET111YMR257C 2403 nt0.36□□□□□ -2.35
MSF1P08425 ASE1YOR058C 2658 nt0.35□□□□□ -2.35
MSF1P08425 SBH1YER087C-B 249 nt0.35□□□□□ -2.35
MSF1P08425 MRPL50YNR022C 420 nt0.35□□□□□ -2.35
MSF1P08425 NIP100YPL174C 2607 nt0.35□□□□□ -2.35
MSF1P08425 BUL2YML111W 2763 nt0.35□□□□□ -2.35
MSF1P08425 FYV10YIL097W 1551 nt0.35□□□□□ -2.35
MSF1P08425 MLP2YIL149C 5040 nt0.32□□□□□ -2.36
MSF1P08425 MLP1YKR095W 5628 nt0.31□□□□□ -2.36
MSF1P08425 YDR426CYDR426C 378 nt0.31□□□□□ -2.36
MSF1P08425 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt0.31□□□□□ -2.36
MSF1P08425 VIK1YPL253C 1944 nt0.3□□□□□ -2.36
MSF1P08425 YLR456WYLR456W 615 nt0.3□□□□□ -2.36
MSF1P08425 SEC8YPR055W 3198 nt0.29□□□□□ -2.36
MSF1P08425 BEM3YPL115C 3387 nt0.29□□□□□ -2.36
MSF1P08425 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.29□□□□□ -2.36
MSF1P08425 snR189snR189 189 nt0.29□□□□□ -2.36
MSF1P08425 ESP1YGR098C 4893 nt0.28□□□□□ -2.36
MSF1P08425 HMRA2YCR096C 360 nt0.28□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.3 ms