Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms