Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSP90AB1P08238 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HSP90AB1P08238 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms