Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF1RP07333 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms