Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFMP07197 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFMP07197 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFMP07197 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFMP07197 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFMP07197 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFMP07197 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFMP07197 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFMP07197 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFMP07197 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFMP07197 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFMP07197 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFMP07197 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFMP07197 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFMP07197 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFMP07197 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFMP07197 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFMP07197 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFMP07197 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEFMP07197 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEFMP07197 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEFMP07197 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEFMP07197 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEFMP07197 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NEFMP07197 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NEFMP07197 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEFMP07197 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEFMP07197 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEFMP07197 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEFMP07197 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NEFMP07197 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEFMP07197 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEFMP07197 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEFMP07197 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFMP07197 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFMP07197 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFMP07197 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFMP07197 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFMP07197 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFMP07197 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFMP07197 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFMP07197 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFMP07197 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFMP07197 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFMP07197 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFMP07197 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFMP07197 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFMP07197 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFMP07197 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFMP07197 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFMP07197 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFMP07197 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFMP07197 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFMP07197 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFMP07197 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFMP07197 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFMP07197 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFMP07197 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFMP07197 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFMP07197 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFMP07197 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFMP07197 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFMP07197 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFMP07197 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFMP07197 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFMP07197 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFMP07197 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFMP07197 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFMP07197 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFMP07197 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFMP07197 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFMP07197 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFMP07197 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms